我国发布超大规模药物筛选平台，一批公司吃上AI红利

  虚拟筛选是现代新药研发的关键流程之一。超大规模药物虚拟筛选平台GalaxyVS即将正式发布，将传统需数月甚至数年的药物早期筛选过程缩短至数十秒。A股市场上，不少生物医药公司积极搭建虚拟筛选平台，在AI驱动下，有公司研发效率提升50%。

  来源：摄图网

  我国实现千亿级分子库秒速检索筛选，系全球首次

  5月30日，清华大学和国家超级计算天津中心将正式联合发布超大规模药物虚拟筛选平台——GalaxyVS。

  该平台依托新一代天河超算系统，在全球范围内首次实现对近千亿级可合成化合物空间的秒级虚拟筛选，将传统需数月甚至数年的药物早期筛选过程缩短至数十秒，将为全物种药物研发创造更多可能性。

  实测数据显示，系统利用千级DSP节点完成全模式生物物种约400万个靶点口袋的高效编码，并在2万多个计算节点上开展超大规模分子检索。单次检索千亿分子库仅需几十秒内即可完成，平均单个靶点口袋检索用时不到1秒。系统日吞吐量达约16万亿次分子对接，比当前国际最先进的超算纪录高出6个数量级。

  项目团队核心成员、国家超级计算天津中心李培顺博士介绍，GalaxyVS不是对既有模型的简单放大，而是围绕近千亿级化学空间重构了一套“AI模型+超级计算+高性能检索+药物化学约束”的全流程平台。该平台以清华大学智能产业研究院团队前期发表于《科学》杂志的DrugCLIP模型为基础，将蛋白口袋与小分子映射到统一向量空间，把传统依赖逐一对接的蛋白—配体匹配问题，转化为可大规模并行执行的高维向量快速检索问题，从根本上突破了传统分子对接在速度和规模上的限制。

  在算力层面，GalaxyVS充分发挥新一代天河超算的大规模并行能力。团队基于YH-Torch智能计算框架，对DrugCLIP模型开展国产异构算力适配与深度优化，替换传统CUDA/GPU依赖，使近千亿级分子编码从算法设想真正转化为可稳定运行的超算工程。在检索环节，系统引入磁盘原生图索引框架并结合定制化内存预加载机制，有效解耦共享存储瓶颈与计算执行过程，为超大规模虚拟筛选提供了关键吞吐能力。

  李培顺博士表示，这一平台将有效破解传统药物研发中“活性分子稀少、可筛空间不足、候选分子同质化”的难题，为肿瘤、神经退行性疾病、新发传染病、罕见病等领域的先导分子发现提供全新路径，同时在突发公共卫生事件中可大幅提升药物研发响应速度。

  多家CRO公司搭建自有虚拟筛选平台

  虚拟筛选（Virtual Screening，VS）也称计算机筛选，即在进行生物活性实验筛选之前，利用计算机上的分子对接软件模拟目标靶点与候选药物之间的相互作用，计算两者之间的亲和力大小，以降低实际筛选化合物数目，提高先导化合物发现效率。

  不少上市公司正积极搭建自有筛选平台，赋能药物研发，尤其是临床前研究服务（CRO）公司。

  其中，上海泓博智源医药股份有限公司（证券简称：泓博医药；证券代码：301230.SZ）2026年3月在互动平台上称，DiOrion平台作为公司自主研发的赋能药物研发的工具，已集成多个核心模块，如分子设计、虚拟筛选、成药性评估等，该平台处于稳步迭代升级中。

  泓博医药2025年年报显示，DiOrion平台通过模块化架构与智能技术的深度融合，可显著提升药物研发的效率与精准度，在整合新药研发项目中发挥着日益重要的作用，可助力客户缩短从药物发现到上市的周期，提升药物研发的成功率与市场竞争力。

  上海皓元医药股份有限公司（证券简称：皓元医药；证券代码：688131.SH）披露，公司整合计算机辅助药物设计（CADD）和人工智能辅助药物设计（AIDD）算法，综合使用分子对接、AI深度学习、分子动力学模拟等方法，通过先进的算法和算力，快速识别潜在的药物候选分子，已搭建集高价值化合物库、技术与服务、MedChemAI智能平台于一体的“一站式药物筛选平台”，灵活支撑新药研发及新适应症探索应用场景。

  目前，该平台已建成生物活性化合物库、类药多样性化合物库等多种高价值化合物库，支撑高通量筛选（HTS）、高内涵筛选（HCS）、虚拟筛选（VS）等业务需求，助力新药研发及新适应症探索；同时依托AI算法提供化合物库定制开发、先导化合物优化、DNA编码化合物库（DEL）合成与筛选等综合服务。其中，MedChemAI智能平台集成化合物库筛选、批量搜索报价、化合物库生成、AI大环分子生成及定制合成等一站式线上服务，为研发客户提供智能化、一站式创新药研发解决方案。

  睿智医药科技股份有限公司（证券简称：睿智医药；证券代码：300149.SZ）在化学业务方面通过人工智能辅助药物设计及开发，提供客户大数据分析及机器学习和建模，合作整合了2000万个小分子的数据库用于虚拟筛选。

  在AI技术赋能上，睿智医药系统性构建“科研智能平台”，以本地化部署与外部合作结合的方式推进落地。其中，在生物大分子领域，公司搭建了AI辅助抗体发现、多肽虚拟筛选平台。

  “AI+”应用落地，有公司研发效率提升50%

  目前，已有多家上市公司收获技术红利。

  科兴生物制药股份有限公司（证券简称：科兴制药；证券代码：688136.SH）的KX-BODY抗体药物开发核心技术平台，包含了FIT-body单抗筛选技术、FIGHT-body双抗设计技术和FLEX-body多抗设计及筛选技术等核心技术。

  科兴制药表示，KX-BODY融合了AI技术和CADD等高智能技术手段，相关技术在GB12项目得到了高效的应用和验证，借助AI驱动的抗体设计技术，通过从头设计、虚拟筛选的方式在较短时间内得到高活性的IL-4R纳米抗体，研发效率提升50%。

  武汉海特生物制药股份有限公司（证券简称：海特生物；证券代码：300683.SZ）称，已搭建起完善的生物大分子药物研发平台，通过多平台协同联动，打造出从分子构建到中试生产的全流程系统化创新能力。

  海特生物表示，该平台创新性集成生物大分子虚拟筛选与高效表达技术，整合优化蛋白质结构预测与分子对接技术，实现融合蛋白的精准理性设计，推动研发效率得到显著提升。依托这一技术平台，公司已完成多款新产品的研发与注册申报工作。

  华熙生物科技股份有限公司（证券简称：华熙生物；证券代码：688363.SH）的AI快速筛选活性物平台构建了集虚拟筛选模型、分子动力学模拟、蛋白同源建模于一体的全链路计算研发体系。平台以皮肤生物学靶点与关键功效通路为核心，实现百万级分子库的多靶点并行筛选、多通路协同预测、分子互作动态模拟，大幅度提升活性成分发现效率。

  基于该平台智能优选与定向优化的活性组合，华熙生物已成功落地润百颜修莹焕亮精华和肌活轻酸精华，实现“分子设计→机制验证→配方量产”的全链条科技转化。